《青海师范大学学报》（自然科学版）是由青海省教育厅主管、青海师范大学主办的综合性学术理论刊物。创刊于1979年，本刊坚持自然科学的正确导向，遵循理论联系实际，学术结合时代的宗旨，以繁荣自然科学，深化教育教学改革为己任，突出学术性、地方性、师范性，及时反映和宣传我校的学科优势和学术特色，以及对外交流最新科研成果和学术思想，是学校与国内外同行进行学术交流的桥梁，是展示学校办学水平和风貌的窗口。

主要栏目有：数学、物理、化学、计算机、高原生物、高原体育、工程学、医药学等。《青海师范大学学报》（自然科学版）先后获得过全国高校优秀科技期刊，教育部优秀科技期刊，青海省优秀期刊的荣誉。